Orchideje se dočkaly prvního přečteného genomu

Orchideje, čili jedna z nejvíce pestrých čeledí kvetoucích rostlin, se konečně zařadily mezi skupiny s přečteným celým genomem. V Nature Genetics z toho udělali událost nového čísla.

Za genomem orchideje stojí mezinárodní seskupení Orchid Genome Project, který vedou Lai-Qiang Huang a Zhong-Jian Liu z Univerzity Tsinghua a Národní centrum ochrany orchidejí v Šen-čenu.

Jejich tým přečetl kompletní genom orchideje Phalaenopsis equestris, významného rodičovského druhu pro šlechtění komerčních odrůd těchto orchidejí. P. equestris je také první rostlinou s přečteným kompletním genomem, která provozuje sukulentní CAM metabolismus (Crassulacean Acid Metabolism).

Podle odhadu autorů obsahuje přečtený genom 29 431 proteinových genů. Průměrná délka jejich intronů činí  2 922 párů bazí, což je mnohem víc, než u všech ostatních doposud přečtených genomů rostlin. Detailní analýzy naznačují, že hlavní příčinou takové délky orchidejových intronů jsou do nich vnořené transpozony.

Podobně jako u řady jiných genomů rostlin, i u orchidejí vědci vystopovali dávnou událost paleopolyploidie, která předcházela rozvoji většiny linií dnešních orchidejí. Není vyloučeno, že tahle událost významně přispěla k tomu, že se z orchidejí stala jedna z nejbohatších čeledí kvetoucích rostlin.

Kompletní genom P. equestris se bezpochyby stane významným zdrojem dat pro studium diverzity a  evoluce orchidejí. Zároveň sehraje významnou roli i při vývoji nových konceptů a technologií genetického inženýrství těchto pozoruhodných květin a jistě nejen jich.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: