Crowdfundingové genomy prozrazují tajemství kapradin

V roce 2014 se autorům projektu čtení genomu vodních kapradin podařilo získat dostatek finančních prostředků. A po čtyřech letech máme pozoruhodné výsledky. 

Vědci vybrali na crowdfundingové platformě Experiment.com celkem 22 160 dolarů, což nakonec stačilo nejen na přečtení genomu zamýšlené plovoucí vodní kapradiny Azolla filiculoides, ale také další plovoucí kapradiny Salvinia cucullata. Fay-Wei Li a Kathleen Pryer z Dukeho univerzity společně s dalšími kolegy tím pádem získali první kompletní genomy kapradin vůbec. Kapradiny mají obvykle gigantické genomy, plovoucí kapradiny jsou výjimkou.

Pryerová se snažila získat finance pro čtení zmíněných kapradin téměř 20 let. Obvykle jí ale bylo řečeno, že jde o příliš nekonvenční nebo nedůležité projekty. Nakonec jim pomohla online crowdfundingová kampaň, která byla více než úspěšná.

Kampaň rovněž přitáhla pozornost čínského institutu Beijing Genomics Institute (BGI), který jim zafinancoval veškeré čtení sekvencí. Díky tomu, a také spolupráci s Utrechtskou univerzitou se jim nakonec podařilo podniknout výpravu do doposud neznámé končiny genomu kapradin.

Podle badatelé mají azoly velmi zajímavou biologii a evoluční historii. Mimo jiné vstupují do symbiózy se sinicemi, díky čemuž se v Asii již dlouhá staletí využívají jako zelené hnojivo rýžovišť.

Přečtení genomu azoly ukázalo, že postrádá geny nezbytné pro obvyklé typy mykorrhiz. Namísto toho azola vlastní několik genů, které umožňují symbiózu se sinicemi rodu Nostoc, jejichž genomy jsou už delší dobu přečtené. Podle Pryerové teď bude možné získat tajemství této přírodní technologie biologického hnojiva, a využít je v biotechnologii a v zemědělství.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: