Příjemně malý genom výjimečně odolné trávy nabízí zajímavé objevy

Vědci nedávno získali téměř kompletní genom trávy Oropetium thomaeum. Jde o odolnou poikilohydrickou rostlinu, která dokáže přežít extrémní a dlouhotrvající sucho.

V centru Donald Danforth Plant Science Center přečetli její genom o velikosti 245 Mb pomocí technologie SMRT (single molecule, real-time sequencing) systémem PacBio RS II. Výsledek je prý přesný na 99,99995% a zahrnuje sekvence telomer a centromer, LTR retrotransposony, tandémově duplikované geny a další součásti genomu, jejichž čtení bývá velmi komplikované.

Badatelé přečetli genom odolné trávy v rámci programu "Most Interesting Genome in the World" společnosti Pacific Biosciences, aby tím přispěli k pochopení biologických mechanismů, které zodpovídají za její výjimečnou odolnost vůči suchu. Podle šéfa výzkumu Todda Mocklera si trávu Oropetium thomaeum vybrali v neposlední řadě kvůli tomu, že má nejmenší známý genom ze všech trav. Trávy jsou jinak proslulé tím, že jejich genomy nebývají právě malé.

Tato poikilohydrická tráva přežívá v pouštních podmínkách. I když vypadá naprosto uschle, tak si v těle dovede dlouho udržet část původního obsahu vody. Je to rostlina s C4 metabolismem, pocházející ze skal v suchých oblastech V a SV Afriky, Indie a JV Asie. Přitom jako tráva je blízce příbuzná celé řadě klíčových plodin, pícnin a bioenergetických rostlin. Z genomu této trávy bychom tudíž mohli vytěžit zajímavé nápady a triky, jak vylepšit odolnost vůči suchu u rozmanitých pěstovaných druhů rostlin.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: