Genetici přečetli genom populární rýže basmati

Tým amerických odborníků využil inovativní technologii čtení genomů a dal dohromady genom dvou odrůd rýže basmati. Jedna z nich je přitom odolná vůči suchu a také je rezistentní k bakteriálnímu onemocnění. Výsledky studie, kterou publikoval časopis Genome Biology, rovněž ukazují, že rýže basmati je ve skutečnosti hybridem mezi zástupci dvou dalších skupin rýží.

Název basmati je odvozený od hindského výrazu pro „voňavý“. Jde o aromatickou rýži s charakteristickými dlouhými zrny, která se pěstuje v jižní Asii. Navzdory jejímu značnému ekonomickému a kulturnímu významu, byla až doposud evoluční historie rýží okruhu basmati nejasná.

V současné době je významným nástrojem ke studiu pěstovaných plodin i k jejich vylepšování čtení celých genomů těchto rostlin. V rámci dřívějších výzkumů četli genetici genom rýže basmati pomocí tradičních metod, během nichž se čtený genom rozláme na malé kousky, a ty se pak čtou jeden po druhém a skládají dohromady. Tímto způsobem ale nepřečetli celý genom rýže basmati.

Vědci amerického centra Center for Genomics and Systems Biology na New York University přečetli genomy dvou odrůd rýže basmati pomocí nedávno vyvinuté technologie nanopórového čtení genomu. Tuto technologii vyvinula společnost Oxford Nanopore Technologies, která se rovněž podílela na čtení rýže basmati. Nanopórové čtení genomu představuje třetí generaci těchto metod. Umožňuje číst dlouhé molekuly DNA, rychle a efektivně, což podstatně zrychluje a zjednodušuje výzkum genomů i s ním spojené aplikace.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: