DNA analýzy pro zhodnocení kvality tekoucích vod

Pro určení kvality vody se často používají organismy, které v dotyčné vodě žijí. Potíž je ale v tom, že celá řada vodních organismů vypadá obdobně a jejich záměna vede k chybám v odhadu kvality vody. Proto se nové metody určování kvality vody podle organismů orientují na analýzy DNA.

Biologové německého Ruhr-Universität Bochum (RUB) vypiplali novou metodologii, která jim teď umožňuje rychle a spolehlivě identifikovat mnoho organismů najednou, s využitím krátkých DNA sekvencí.

Průmysl, zemědělství i lidské osídlení zatěžují prostředí tekoucích vod. Některé organismy změny ve vodách nezvládají a zmizí. Jejich přítomnost či nepřítomnost proto představuje vcelku šikovný ukazatel kvality vody. Stačí jen organismy pochytat a správně určit.

Dnešní doba ale příliš nepřeje odborníkům na taxonomii a počet expertů, kteří jsou schopni určovat drobné vodní živočichy, trvale klesá. Po celém světě se tomuto odvětví taxonomie věnuje jenom málo mladších badatelů. Proto se odborníci RUB snaží uchovat znalosti expertů alespoň v podobě expertního systému.

Pro tento účel vytvářejí databázi, která bude hrát roli virtuálního experta. Experti z masa a kostí nejprve určují vodní organismy a odborníci na barcoding pak přečtou charakteristické kousky jejich genomu a vytvoří profil těchto organismů, který zahrnuje i informaci o jejich nárocích na vodu. Uživatelé této databáze pak jenom naloví vodní organismy, přečtou jejich DNA a svá data proženou databází.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: