CRISPR-SNP čip detekuje jednopísmenné mutace

Technologie CRISPR na čipu není úplně nová. Kiana Aran z amerického institutu Keck Graduate Institute (KGI) a University of California, Berkeley ji poprvé představila v roce 2019.

Teď přichází s pokročilou verzí tohoto systému CRISPR-SNP-Chip, která umožňuje detekci jednopísmenných mutací, aniž by bylo nutné amplifikovat DNA vzorku. Prozatím to funguje pro srpkovitou anémii a amyotrofickou laterální sklerózu.

Jak uvádí Aranová, v dnešní době se bouřlivě rozvíjí diagnostika založená na genetickém editoru CRISPR, díky programovatelnosti a jednoduchému použití tohoto úžasného molekulárního nástroje. Většina systémů pro CRISPR diagnostiku jsou ale stále závislé na amplifikaci vzorku anebo optické detekci výsledků. Plný potenciál CRISPR diagnostiky bude podle Aranové možné využít, až když použijeme grafenové tranzistory namísto optické detekce a vyhneme se nutnosti amplifikace. Přesně takový je CRISPR-SNP-Chip.

Detekce jednopísmenných mutací SNP (single nucleotide polymorphism) jsou zásadní pro lidskou genetiku. Zároveň se ale významně uplatňuje ve farmakologii, zemědělství, a také ve výzkumu rezistence k antibiotikům. Technologie bez amplifikace a optické detekce by teď mohla detekci SNP zpřístupnit v ještě mnohem větším měřítku.

CRISPR-SNP-Chip by se mohl osvědčit v laboratořích genetického výzkumu, v lidské i veterinární diagnostice a také v praktických aplikacích biosensingu, které byly doposud omezené na laboratoře.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: