Datum: 13.4.2016
Vědci přečetli 230 různých genomů archaeí a bakterií, aby jejich analýzou prozkoumali roli, jakou hraje metylace DNA u mikrobů.
Epigenom buňky představuje soubor všech změn komponent DNA, které ovlivňují fungování genomu buňky. Tyto změny jsou přitom výsledkem chemických úprav, obvykle metylace, tedy připojení metylového zbytku k cytosinu a někdy i k adeninu.
Odhalení epigenomické diverzity mikrobů by mohlo přispět k pochopení role mikroorganismů v globálních cyklech jednotlivých chemických prvků a také vystopovat regulační systémy, které u nich fungují na úrovni genomu.
Nejběžnější epigenetická změna, tedy metylace DNA, významně reguluje expresi genů u eukaryot. Už sice víme, že metylace DNA funguje i u archaeí a bakterií, role tohoto procesu v mikrobiální buňce ale zůstává nejasná.
Proto se tým institutu Energy Joint Genome Institute amerického ministerstva energetiky (DOE JGI) rozhodl analyzovat metylaci DNA v genomech 230 bakterií a archaeí. Použili k tomu čtení jediné molekuly DNA, čili technologii SMRT (Single Molecule Real-Time).
Badatelé objevili metylaci DNA v genomech 215 přečtených mikrobů (93 procent). Enzymy metylující DNA (MTázy) jsou podle všeho u mikrobů součástí obrany proti virům a celá řada jich je zřejmě zapojená v regulaci mikrobiálního genomu. Zdá se, že metylace DNA hraje ve fungování buněk archaeí a bakterií mnohem významnější roli, než jsme si mysleli.
Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.
Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.
Více informací najdete zde:
Gate2Biotech - Biotechnologický portál - Vše o biotechnologiích na jednom místě.
ISSN 1802-2685
Tvorba webových stránek: CREOS CZ
© 2006 - 2024 Jihočeská agentura pro podporu inovačního podnikání o.p.s.
Zajímavé články s biotechnologickým obsahem:
Biotechnology - Biotechnologický portál Gate 2 Biotech
Práce na vedlejší pracovní poměr
Nově objevená kvasinka brání houbovým infekcím konkurencí
Výzkum genomů magických houbiček míří k novým kultivarům