Ústní bakterie podle superpočítačů reagují na zdravotní stav

Bakterie v ústech mohou dramaticky zareagovat na řadu onemocnění jejich hostitele. Dospěly k tomu superpočítače v Texas Advanced Computing Center (TACC).

Podle místních vědců by tyto poměrně překvapivé výsledky mohly vést k lepší prevenci, diagnostice či léčbě periodontitidy, cukrovky, Crohnovy nemoci a řady podobných onemocnění.

Šéf výzkumu Marvin Whiteley z Texaské univerzity v Austinu a jeho kolegové zkoumali, jak ústní bakterie fungují u zdravých lidí a jak se jejich chování změní v případě nemoci. Nakonec se ukázalo, že tahle změna může být u ústních bakterií doopravdy veliká.

Ústní bakterie, tak jako jiná společenstva bakterií v nejrůznějších prostředích planety sdílejí živiny, spolupracují, navzájem se požírají a vůbec vedou velmi bohatý společenský život.  V případě ústních bakterií se výrazně změní právě sdílení živin a interakce mezi jednotlivými typy bakterií.

Badatelé ve studii uveřejněné časopisem mBio využili metagenomové shotgun sekvenování, kterým lze najednou prostudovat velké množství genetického materiálu bakteriálního společenstva najednou. Whiteley a spol. analyzovali nalovenou RNA na superpočítačích centra TACC jménem Lonestar a Stampede. Cenný výpočetní čas na nich získali díky iniciativě Texaské univerzity UT System Research Cyberinfrastructure. Samotný výzkum financovala vládní agentura National Institute of Dental and Craniofacial Research.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: