pAblo pCasso je novým nástrojem pro CRISPRové technologie

Nový nástroj pro technologie spojené s mainstreamovým genetickým editorem CRISPR-Cas se svůdným názvem „pAblo·pCasso,“ by mohl změnit odvětví editování bakteriálních genomů. Nabízí nevídanou přesnost a flexibilitu v genetickém inženýrství.

Tento nástroj vyvinuli odborníci výzkumného centra Novo Nordisk Foundation Center for Biosustainability (DTU Biosustain). Jeho přínosem je rozšíření míst v genomu dostupných pro base editing a značné urychlení vývoje GM bakterií pro rozmanité biotechnologické aplikace.

pAblo·pCasso přináší nový standard pro technologie z okruhu CRISPR-Cas. Klíčovou inovací nového systému jsou přesné a reverzibilní editace DNA u gramnegativních bakterií. Předchozí systémy z rodiny CRISPR tohle nedokázaly. Nástroj využívá specializované fúzované enzymy, což jsou modifikované verze standardního enzymu Cas9, spojené s moduly CBE nebo ABE. Tyto moduly fungují jako přesné molekulární „tužky“ pro přepisování nukleotidů v sekvenci editované DNA.

Vývoj nástroje pAblo·pCasso nebyl jednoduchý. Badatelé museli překonat řadu technických překážek. Například, konvenční CRISPR systémy jsou omezené tím, že vyžadují specifické DNA sekvence (PAM sekvence), které se nacházejí poblíž cílového místa editace. Kvůli tomu jsou tyto konvenční systémy méně efektivní při editování, v němž je nutné změnit jediné písmeno sekvence. pAblo·pCasso tyto obtíže překonává díky zmíněným fúzovaným variantám enzymu Cas9. Nevyžaduje specifické PAM sekvence, což rozšiřuje jeho pole působnosti v genomu.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Zdroj obrázku: Kozaeva et al. (2023), Nucleid Acid Research.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: