Oxford Nanopore zveřejnili první data z přenosné čtečky genomu

Obstojný začátek, ale ne zásadní průlom. Tak prozatím vědci hodnotí první zveřejněná data z MinIONu, velmi očekávané pokročilé čtečky DNA od britských Oxford Nanopore.

MinION usiluje o titul prvního, komerčně dostupného sekvenátoru, který využívá dlouho vyvíjenou technologii nanopórů. Ta spočívá ve čtení bází DNA ze změny elektrické vodivosti při průchodu nanopórem. Podle společnosti Oxford Nanopore by jejich nanopórové čtečky DNA měly být rychlejší a levnější, nežli soudobé technologie čtení DNA a také by měly umožnit analyzovat obtížně přístupné oblasti genomu.

MinION se doposud neprodává, mezi vědce se už ale dostal. David Jaffe z Broad Institute v Cambridge, Massachusetts, použil data získaná MinIONem a uvolněná Oxford Nanopore při poskládání dvou bakteriálních genomů. Jedním z nich byla notoricky známá Escherichia coli, druhým bakterie rodu Scardovia, která žije v lidských ústech. Baffe nedávno publikoval výsledky na setkání Advances in Genome Biology and Technology, které proběhlo na floridském ostrově Marco.

Podle Jaffa je MinION hezká krabička nevelkých rozměrů, která se připojuje k USB portu. Když si MinION zapnete, jako by se vás dotkla budoucnost. První recenze jsou ale poněkud rozpačité.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: