Japonští vědci přečetli genom krásné povijnice Ipomoea nil

Vědci v Japonsku zaznamenali další úspěch při čtení komplikovaných genomů kvetoucích rostlin. Jejich úlovkem se stala hezká povijnice Ipomoea nil z čeledi svlačcovitých. Tyto rostliny se tradičně pěstují v japonských zahradách a dodnes jsou v Japonsku populární. 

S jejich květy se lze v Japonsku během léta setkat téměř na každém kroku. Zároveň velmi často rozmanitě mutují, což je způsobeno velkou aktivitou skákajících sekvencí, transpozonů.

Od období Edo, tedy z doby asi před 200 lety, se v Japonsku pěstují povijnice se zvláštními květy a listy. Kolem povijnic se tam rozvinula celá unikátní zahradní kultura.

Kvůli popularitě takto zmutovaných povijnic japonští zahradníci objevili a pěstovali celou řadu přirozeně vzniklých mutantů. Když mutanty povijnic dostali do rukou současní vědci, a pečlivě je analyzovali, tak identifikovali celou řadu genů, které regulují tvar květů i listů, jakož i barvu květů.

Yasubumi Sakakibara z Keio University a jeho spolupracovníci přečetli celý genom povijnice Ipomoea nil dnešními standardními metodami, a poté ho analyzovali s využitím pokročilých bioinformatických nástrojů.

Badatelé získali téměř kompletní sekvenci vysoké kvality. Našli v ní kódující sekvence přibližně 43 tisíc genů povijnice, a zároveň i spoustu transpozonů, které jsou zodpovědné za ohromující pestrost povijnic.

Přečtený genom povijnice Ipomoea nil je zajímavý nejen pro studium povijnic, transpozonů a genů ovlivňujících rozmanitost květů a listů, ale také pro výzkum velmi blízce příbuzných povijnic batátových, jejíž kořenové hlízy jsou známé jako sladké brambory.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: