Intenzivní čtení genomů odhaluje adaptační strategie topolů

Po desetiletí výzkumu rostlinných genů na drobných a rychle rostoucích bylinách vědci jejich funkce u stromů spíš jen odhadovali. Na Virginské polytechnice a dalších institucích teď přečetli a analyzovali kompletní genomy 544 různých stromů jediného modelového druhu.  Ve studii publikované časopisem Nature Genetics se tak snažili odkrýt tajemství adaptace oblíbeného topolu Populus trichocarpa, rozšířeného na velkém území západní části severní Ameriky, na různé typy klimatu.

Podle členky výzkumného týmu, molekulární genetičky Amy Brunner, jsou naše znalosti genetického základu adaptací rostlin na prostředí z veliké částice založené na výzkumu huseníčku Arabidopsis thalliana, což je drobný plevel z čeledi brukvovitých s velmi krátkým životním cyklem. V takovém případě je samozřejmě otázkou, co všechno nám mohou říct geny plevele o adaptacích stromů se zcela odlišnou životní strategií.

Brunnerová a spol. se to rozhodli prověřit na topolu Populus trichocarpa, který je modelovým druhem stromu v molekulární biologii a genetice. Sehnali si vzorky od více než 500 stromů z většího počtu populací tohoto druhu, které rostou ve čtyřech různých klimatických oblastech, od Kalifornie až po Britskou Kolumbii.

Přečtením a následnou analýzou jejich genomů se snažili zjistit, jak se topoly adaptují na různé klima a jak by bylo možné tyto informace využít při šlechtění nových odrůd tohoto topolu pro různé typy prostředí.

Podle Brunnerové při výzkumu nepotřebovali dopředu vědět, které geny budou důležité. To se ukázalo v analýzách stovek přečtených genomů. Dalším krokem pak je zjistit, proč jsou dotyčné geny pro adaptace na klima významné.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: