Hojné sinice v oceánu jsou pozoruhodně geneticky pestré

Drobné a nesmírně hojné sinice rodu Prochlorococcus jsou klíčovým hráčem v ekosystémech oceánu. Je jich tam doopravdy hodně, snad miliarda miliard miliard a vytvářejí v oceánu základ potravinového řetězce.

Zároveň obývají rozmanitá prostředí moří, s různou teplotou, množstvím dopadajícího světla, chemií a také v rozdílných společenstvech. Jejich genetická pestrost ale zatím zůstávala záhadou.

Vědci z MIT se rozhodli prozkoumat genetickou diverzitu prochlorokoků analýzou genomů v jejich přírodních populacích, po jednotlivých buňkách. Ukázalo se, že v jediném mililitru mořské vody fungují stovky geneticky odlišných subpopulací, místních skupin prochlorokoků.

Každá z těchto skupin přitom vlastní charakteristický soubor alel, které badatelé přezdívají páteřní část genomu. Tyto páteřní alely zodpovídají za jemné nastavení ekologie jednotlivých skupin prochlorokoků tak, aby vyhovovala místním podmínkám. Rozmanitost panuje i uvnitř místních skupin prochlorokoků. Jednotliví mikrobi často nesou alespoň jeden ucelený, takzvaný flexibilní soubor genů, který je v rámci skupiny unikátní.

Vědci odhadují, že se místní skupiny prochlorokoků geneticky zformovaly minimálně před pár miliony let. Páteřní soubory genů jsou starší a představují pomalu se vyvíjející části genomu. Flexibilní geny jsou zase v oblastech genomu, kde probíhá intenzivnější evoluce.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: