Databáze struktury rostlinných proteinů pomůže výzkumu genů rostlin

Pečlivé analýzy struktur tisíců rostlinných proteinů, které uskutečnil Tetsuya Sakurai a jeho kolegové z RIKEN Center for Sustainable Resource Science, vedly k vybudování databáze struktur rostlinných proteinů. Tato databáze by měla významně podpořit výzkum funkce mnoha rostlinných genů. 

V dnešní době už máme k dispozici kompletní genomy celé řady druhů rostlin a známe jejich geny. Funkce mnoha z těchto genů ale zůstávají neznámé.

Huseníček thallův Arabidopsis thaliana je nejslavnějším modelovým druhem molekulární biologie rostlin, jeho relativně malý genom je přečtený ze všech možných stran a už 15 let ho známe do posledního písmena. Přesto ale neznáme funkci přinejmenším jedné třetiny jeho genů.

Sakurai a jeho kolegové se rozhodli, že tyto citelné mezery v poznání biologie rostlin alespoň z části zaplní výzkumem struktury proteinů, které jsou produkty zmíněných genů s neznámou funkcí.

Každý protein má specifickou trojrozměrnou strukturu, která je daná sekvencí jeho aminokyselin. Podle Sakuraiho nám informace o struktuře proteinů může pomoct objasnit funkci jednotlivých genů, protože v mnoha případech dovedeme odhadnout, jak která struktura může fungovat.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: