100 tisíc struktur v proteinové databance

Globální síť Světová proteinová databanka (wwPDB) nedávno oznámila, že počet záznamů v jejím archivu překročil magickou hranici 100 tisíc.

Tento veřejný archív experimentálně zjištěných struktur proteinů a nukleových kyselin založili v roce 1971 a svého nynějšího milníku dosáhl především díky neutuchajícímu snažení strukturálních biologů celého světa.

V dnešní době zajišťují online přístup ke trojrozměrným modelům biologických molekul celkem čtyři datová centra wwPDB. Využívají je vědci z mnoha oborů biologie, medicíny, ekologie i zemědělství, kteří řeší otázky spojené se vším možným od lidského zdraví až po biologicky vytvářenou energii.

Mezi úplně prvními záznamy se do Světové proteinové databanky dostaly struktury myoglobinu a hemoglobinu, čili molekul, které s oblibou váží kyslík. Za objasnění jejich struktury dostali John Kendrew a Max Perutz Nobelovu cenu. Při pravidelném týdenním (14. května) update přibylo do archivu 219 nových záznamů, čímž se jejich počet zvýšil na 100 147.

Světová proteinová databanka teď roste velmi svižně. Od roku 2008 se počet zdejších záznamů zdvojnásobil a poslední dobou činí jejich přírůstek kolem 200 týdně. Zdejší databáze má přitom stovky milionů online přístupů ročně, od badatelů, studentů i vyučujících, které zajímají záležitosti spojené se strukturou proteinů.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: