Nanopórové sekvenování RNA detekuje otisky prstů nádorů

Jak zjistil španělský výzkumný tým, různé typy mají své unikátní molekulární „otisky prstů,“ které je možné detekovat s téměř perfektní přesností s využitím malých přenosných skenerů během pár hodin. Tyto otisky je možné přečíst s využitím nanopórového sekvenování RNA.

Jde o výzkum odborníků centra Centre for Genomic Regulation (CRG) v Barceloně. Jejich výsledky by se mohly stát základem nových neinvazivních testů pro detekci nádorů v rané fázi, rychleji a ještě dříve, než je dnes možné.

Ribozomy jsou nukleoproteinové výrobní linky na proteiny. Tvoří je ribozomální RNA, na kterou jsou navěšené konstrukční proteiny. Ribozomální rRNA je častým cílem chemických modifikací, které ovlivňují funkci ribozomu. V buňkách je ribozomální RNA velmi početná. Jak uvádí vedoucí výzkumu Eva Novoaová, rRNA představuje zhruba 95 procent RNA, co se v dané chvíli nachází v lidské buňce.

Novoaová a její kolegové studovali zmíněné chemické modifikace rRNA v lidských a myších buňkách pocházejících z různých tkání, včetně mozku, srdce, jater a varlat. Ukázalo se, že každá tkáň má unikátní uspořádání modifikací rRNA. Novoaová a spol. tomu říkají epitranskriptomický otisk prstu.

Následně prozkoumali vzorky tkání pacientů s nádory, především plic a varlat. Zjistili, že v takovém případě je rRNA příslušných buněk méně modifikovaná. Kvůli nádoru ztrácejí část modifikací rRNA, což by se podle vědců mohlo stát slušným biomarkerem dotyčných nádorů.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Zdroj obrázku: Queralt Tolosa/Centro de Regulación Genómica.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: