Mapování obrovského genomu žebrovníka odhaluje tajemství regenerace

Badatelé švédského Karolinska Institutet ve spolupráci s Lunds universitet a německým Zentrum für Regenerative Therapien Dresden zmapovali genom žebrovníka Waltlova (Pleurodeles waltl) a zjišťovali jak je organizace DNA spojená se schopností regenerace celých částí těla.

Mloci jako žebrovník jsou proslulí regenerací velkých oblastí těla a současně i odolností vůči nádorům. Výzkum molekulárních mechanismů, které za to zodpovídají, byl ale až doposud komplikovaný kvůli nedostatku informací o struktuře jejich masivního genomu. András Simon z Karolinska Institutet a jeho kolegové nedávno úspěšně zmapovali genom žebrovníka a přispěli tím k výzkumu regenerace u těchto pozoruhodných tvorů.

Jak uvádí Simon, genom žebrovníka, kterým se zabývali, obsahuje asi 6krát více DNA než lidský genom a obsahuje záplavu krátkých nekódujících sekvencí. Byla to výzva, ale nakonec to zvládli a zmapovali genom žebrovníka podrobněji, než doposud kdo dokázal u organismů s podobně velkým genomem.

S kolegy použili metody pokročilého čtení sekvencí k určení pozic kódujících i nekódujících sekvencí na každém chromozomu žebrovníka. Díky tomu mohli analyzovat vztah struktury genomu k regeneraci poškozených částí těla.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Zdroj obrázku: Shahul Hameed, Simon lab.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: