Evo 2 je prediktivní a generativní inteligence pro tvorbu sekvencí genomů

Odborníci Arc Institute, Stanford University a NVIDIA vyvinuli pokročilou umělou inteligenci Evo 2, která predikuje genetickou proměnlivost a generuje genomové sekvence pro všechny domény života na Zemi.

Testy ukázaly, že Evo 2 se slušnou přesností předpovídá funkční efekty mutací u bakteriálních, archeálních i eukaryotních genomů. Také úspěšně anotovala genom mamuta srstnatého z neupravených sekvencí bez přímého výcviku, což ukazuje na schopnost odhadovat funkce ze samotných sekvencí.

Současné genomické modely mají potíže s předpověďmi funkčních projevů mutací u různých biologických systémů, především u eukaryotních genomů. Algoritmy strojového učení sice předvedly určité úspěchy při modelování interakcí proteinů a genomů bakterií a archaeí, ale eukaryotní genomy se všemi jejich interakcemi dalekého dosahu a regulačními elementy pro ně představují až příliš velkou výzvu.

Inteligence Evo 2 vznikla proto, aby překonala zmíněné obtíže využitím rozsáhlého datasetu pro trénink, který zahrnuje bakterie, archaea, eukaryoty i bakteriofágy a zaměřením spíše na obecné uspořádání genomů než na trénování pro určitou specifickou funkci.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Zdroj obrázku: Brixi et al. (2025), bioRxiv.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: