Vědci prozkoumali funkce proteinu na stříhání RNA

Biochemička Kalifornské univerzity v Berkeley Jennifer Doudna, molekulární biolog Robert Tijan a jejich spolupracovníci důkladně zkoumají možnosti genomových editorů ze skupiny CRISPR editorů. Zaměřili se přitom na protein C2c2 z komplexu CRISPR/C2c2, nedávno objevený u fuzobakterie Leptotrichia shahii, který cílí na sekvenci RNA a nikoliv na DNA.

Protein C2c2 byl objeven jako enzym navádějící CRISPR podle RNA a rovněž stříhající RNA. Odborníci ale doposud přesně nevědí, jak vlastně protein C2c2 funguje. Doudna, Tijan a spol. teď během svého nového výzkumu zjistili, že tento protein disponuje nikoliv jedním, ale hned dvěma mechanismy, které se podílejí na vyhledání a stříhání RNA. Společně tyto mechanismy představují velmi slibný nástroj pro spolehlivou detekci a likvidování RNA.

Podle Doudnové jejich studie významně rozšiřuje pochopení toho, jak funguje protein C2c2 při zpracování RNA. Protein C2c2 hraje roli automatického hlídače, který prohledává všechny RNA v dosahu a hledá mezi nimi požadovanou sekvenci RNA. Doudnová má za to, že bychom schopnosti proteinu C2c2 mohli využít například v automatických detektorech, které by se uplatnily v levné diagnostice.

Každá z nově popsaných RNA aktivit proteinu C2c2 má svou specifickou funkci. První z nich zodpovídá za produkci naváděcí (guide) RNA, s jejíž pomocí protein C2c2 vyhledává specifické molekuly RNA. Druhá z funkcí se aktivuje v případě, když je objevena hledaná molekula RNA. Funguje tak, že rozstříháním zničí veškerou RNA v dosahu.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: