Vylepšená PCR citlivější při detekci patogenů

Vědci vylepšili polymerázovou řetězovou reakci (PCR), která se mimo jiné používá k detekci patogenních mikroorganismů v rostlinných vzorcích. „Genetický materiál patogena nemusí být v infikovaném vzorku v dostatečném množství nezbytném pro detekci." Vysvětluje Norm Schaad z Agricultural Research Service. Díky takovým nedostatkům v diagnostice jsou semena nebo rostliny bez symptomů prodávány jako bezpatogenní, i když takové ve skutečnosti nejsou. Proto vědci vymysleli přípravný krok s názvem Bio-PCR. Ten používá růst podporující agar nebo tekuté médium k zvýšení počtu cílových buněk mikroorganismů. V závislosti na druhu patogena, buňky tvoří tisíce nových kopií umožňujících detekci.

Kromě zvýšené citlivosti 100 - 1000krát než u konvenčních PCR metod, obohacená technika zastavuje inhibitory interferující s účinkem klíčového enzymu PCR - Taq polymerázy. Bio-PCR pracuje nejlépe s rychle rostoucími bakteriemi jako je Ralstonia solanacearum, která způsobuje choroby brambor a rajčat nebo Acidovorax avenue, která škodí na melounech. Bio-PCR ale zlepšuje detekci také pomalu rostoucích patogenů jako je Xylella fastidiosa, bakterie zodpovědné za chorobu hroznů. Na studii s X. fastidiosa, metoda Bio-PCR detekovala bakterii v 90 % infikovaných vzorků hroznů, ve srovnání s 13 %, které odhalila konvenční PCR metoda.

Vlasta Stancová

Zdroj:

www.sciencedaily.com