Datum: 12.9.2018
Malé RNA (anglicky small RNA nebo sRNA) jsou útržky ribozomální nukleové kyseliny, které tvoří méně než 200 nukleotidů. Obvykle jsou nekódující a netvoří se podle nich DNA. Přesto hrají v buňkách a organismech nesmírně významnou roli, především jako regulační molekuly. Velmi významné jsou i pro lidskou medicínu.
V organismech se vyskytuje ohromné množství těchto krátkých RNA. Zatím je ale známe jenom velmi málo a vědci na nich v současné době intenzivně pracují. Používají k tomu zejména pokročilé čtení sekvencí RNA (sRNA-seq). Jejich úsilí ale často vázne na nedostatku vhodných nástrojů, s nimiž by bylo možné identifikovat a analyzovat rozmanité malé RNA ve výstupech ze čtení sekvencí.
Kasey Vickers z americké Vanderbiltovy univerzity a jeho spolupracovníci vyvinuli novou analytickou metodu pro zpracování sekvencí malých RNA v mimobuněčném prostoru, kterou nazvali zvučně TIGER (Tools for Integrative Genome analysis of Extracellular sRNAs).
Fungování TIGERa předvedli na zpracování dat ze čtení sekvencí těchto krátkých RNA získaných z myších lipoproteinů, žluči, moči a jater. V těchto datech TIGER identifikoval 60 až 85 procent přítomných krátkých RNA. Vědci přitom zjistili, že v podstatná část mimobuněčných krátkých RNA v tomto případě pocházela z bakterií mikrobiomu myši nebo z bakterií v okolním prostředí.
Autoři jsou s výsledky spokojeni. Při práci objevili nový lipoprotein, nové krátké RNA z tělních tekutin myši, a rovněž ukázali, že TIGER je solidním nástrojem pro výzkum krátkých RNA.
Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.
Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.
Více informací najdete zde:
Gate2Biotech - Biotechnologický portál - Vše o biotechnologiích na jednom místě.
ISSN 1802-2685
Tvorba webových stránek: CREOS CZ
© 2006 - 2021 Jihočeská agentura pro podporu inovačního podnikání o.p.s.
Zajímavé články s biotechnologickým obsahem:
Masarykova univerzita - Masarykova univerzita
Animal Biotechnology - Biotechnology, Animals
Z toxického pesticidu se stal lék proti rezistentním bakteriím
Na podporu petice více času