Vědci představili periodickou tabulku proteinových komplexů

Jak se vyznat v ohromující pestrosti struktur proteinů živého světa? Zajímavou možnost nabízí nová Periodická tabulka proteinových komplexů. S její pomocí lze zkoumat známé proteiny v přírodě, předpovídat, jaké ještě mohou být objeveny, a také navrhovat zcela nové struktury proteinů.

Tento cenný nástroj pro výzkum evoluce proteinů a proteinové inženýrství vytvořil mezinárodní tým badatelů z Wellcome Genome Campus a University of Cambridge.

Prakticky každý biologický proces závisí na interakcích proteinů a jejich uspořádáním v proteinových komplexech. A mnohá onemocnění souvisejí s problémy ve tvorbě takových proteinových komplexů. Principy, které souvisejí s organizací proteinových komplexů sice ještě úplně nechápeme, nová Periodická tabulka ale zahrnuje základní kroky evoluce proteinových komplexů, a představuje systematický a uspořádaný pohled na tvorbu proteinových komplexů. S pomocí této Tabulky lze chápat biologickou funkci proteinů, takříkajíc vizuálně.

Podle Joea Marshe během evoluce vznikla ohromná spousta proteinových komplexů a na první pohled působí poněkud chaoticky. Stačí ale rozebrat vznik proteinových komplexů na jednotlivé fáze a objeví se základní pravidla, která vysvětlují prakticky všechny proteinové komplexy, které jsme zatím objevili.

Společenské tance jsou rozmanité, můžeme je ale pojmout jako více či méně divoké kombinace několika málo základních tanečních kroků. Stejně tak lze pojmout pestré „tance“ tvorby proteinových komplexů jako víření dimerizace proteinů, jejich cyklizace a jejich spojování. Děje se to prý velmi předpověditelným způsobem, takže není tak těžké předpovídat doposud neobjevené proteiny, nebo navrhovat zcela nové.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: