Vědci přečetli genom biotechnologicky významné klostridie

V Oak Ridge National Laboratory amerického ministerstva energetiky přečetli kompletní genom bakterie Clostridium autoethanogenum, která hraje významnou roli v produkci paliva a chemikálií z rozmanitých materiálů, jako je biomasa nebo průmyslové odpady.

Přečtení genomu v ORNL financovala LanzaTech, biotechnologická společnost z Illinois. Její fermentační platforma využívá bakterie k efektivní přeměně odpadních plynů bohatých na uhlík na paliva a užitečné chemické látky.

Znalost kompletní sekvence dovolí lepší pochopení metabolismu klostridie a nasměruje biotechnologické vývojáře na možná vylepšení pracovitých bakterií, které by pak byly v přeměně biomasy ještě efektivnější. Podle Steva Browna mají laboratoře ORNL spoustu zkušeností se čtením genomů a s jejich následnou analýzou.

Výzkumný tým v případě klostridie přečetl celkem 4,3 milionu párů bází. Použili k tomu technologii RS-II, vyvinutou v Pacific Biosciences (PacBio). Badatelé také porovnali technologie čtení genomu tří generací. V ORNL teď s technologií od PacBio studují genomy celkem šesti různých organismů a dávají dohromady zkušenosti.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: