Vědci poprvé přečetli složitý genom kalužnice křivoklasé

Kalužnice křivoklasá, čili korakán (Eleusine coracana, anglicky finger millet) je pro středoevropana poněkud bizarně vyhlížející obilnina původem z východní Afriky. Její pěstování ale přináší řadu výhod. Kromě toho, že rozšiřuje nabídku obilnin, také obsahuje významné minerály a je solidně odolná vůči vedru a suchu. 

Švýcarští vědci z Curyšské univerzity a jejich spolupracovníci teď díky nové kombinaci pokročilých molekulární technologií poprvé dokázali ve vysoké kvalitě detailně přečíst a sestavit hodně velký a složitý genom kalužnice. Ten teď bude k dispozici pro biotechnology po celém světě.

V dnešní době je kalužnice klíčovou plodinou pro mnoho farmářů světa, hlavně v Indii a Africe. Je cenný zdrojem minerálů, jako je vápník, železo, hořčík a zinek, ale také dalších významných látek, včetně mnoha vitamínů a aminokyselin.

Kalužnice je skutečně odolná a zároveň představuje zdroj zdravé výživy. Také neobsahuje lepek. V rozvinutých zemích dne proto zažívá renesanci a používá se stále častěji k výrobě potravin. Navzdory svému potenciálu ale kalužnice až doposud z velké části unikala zájmu vědců.

Jak to u zemědělských plodin bývá časté, kalužnice křivoklasá původně vznikla jako kříženec dvou příbuzných druhů trav. Jde tudíž o polyploidní druh, který v jádru buněk obsahuje DNA se 4 sádkami chromozomů. Velikost genomu a jeho složité uspořádání souvisí se zajímavými vlastnostmi kalužnice. Zároveň ale právě tohle dohání molekulární biology a genetiky k šílenství. Genom kalužnice je mnohem složitější než například ten lidský a práce s ním je i dnes extrémně náročná.

Proto je úspěch týmu Curyšské univerzity natolik významný. Když zvládli přečíst a zpracovat genom kalužnice, tak to znamená, že si poradili s opravdu velkou výzvou. Genom kalužnice má délku asi 1,5 Gb a obsahuje 62 348 genů. To je dvakrát více, než například v přečteném genomu rýže.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: