V dohledné době si možná každý bude doma číst genomy

Dnes se DNA čte v laboratořích. Do pár let by se ale mohlo sekvenování dostat od vědců k zákazníkům, až do našich domovů. Lidé si budou moci zjistit, jaké mikroorganismy jsou ve vzduchu, otestovat si potraviny anebo prověřit případnou infekci. 

To je hlavní sdělení týmu vědců z Velké Británie a Kanady, kteří vyučují týdenní kurz pro odborníky na Texas A&M AgriLife Research.

Je to něco nového. Účastníci kurzu se neučí sofistikovanou genomiku a bioinformatiku na přístrojích za mnoho milionů dolarů ve špičkových laboratořích. Namísto toho používají minIONy, kapesní systémy pro čtení DNA od Oxford Nanopore Technology. Tahle věc se vejde do ruky a po vložení vzorku se za pár minut v připojeném počítači objeví výsledné sekvence.

Podle instruktora práce s minIONem Johna Tysona z Univerzity Britské Kolumbie ve Vancouveru je na tomto systému atraktivní jeho úžasná přenosnost.

MinION už má za sebou použití k boji proti ebole v pralesích africké Guineje, testování přítomnosti viru zika u lidí i komárů v severovýchodní Brazílii, a také experimenty na Mezinárodní vesmírné stanici.

Podle Charlieho Johnsona, šéfa Genomics and Bioinformatics Service na AgriLife Research, je zařízení jako minION po vědce velkým přínosem z několika důvodů. Lze jej používat prakticky všude, i tam, kde není reálné sehnat drahé a objemné vybavení. Druhou výhodou je rychlost, se kterou je možné mít k dispozici výsledky čtení DNA. Díky zařízením jako je minION se genomika stane běžnou součástí našeho života.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: