Umělá inteligence vyrábí lepší adenovirové vektory pro terapie

Viry AAV (Adeno-associated viruses) představují slibné vektory pro transport genů i při genové terapii nebo třeba léčit při cílené léčbě. Nejsou patogenní a dovednou dopravit náklad do buněk.

První genové terapie s AAV vektory již získaly povolení americké agentury FDA a další budou nepochybně následovat. Přesto ale tyto léčebné postupy zatím nedosáhly plného využití svého potenciálu.

Prvním důvodem je, že se dnes používané částice virů AAV mají sklon se zčásti rozptylovat po těle, kde se rozloží. A dalším problém je to, že imunitní systém pacientů, kteří se již dříve se setkali s podobnými AAV viry, může virové částice použité k léčbě zlikvidovat protilátkami, i když je jejich hladina jen nízká. To samozřejmě znemožní úspěšnou léčbu.

Aby odborníci překonali tento problém, vyvíjejí vylepšené kapsidy virů AAV, které by mohly uniknout imunitnímu systému. Soudobé metody, včetně „řízené evoluce“, ale vytvářejí kapsidy viru s jen omezenou diverzitou, přičemž většina z nich blízce připomíná přírodní varianty AAV virů.

Tým amerického institutu Wyss Institute for Biologically Inspired Engineering vycvičil umělé inteligence, které pak následně použil k vytvoření 200 tisíc variant viru. Z nich bylo 110 689 životaschopných AAV virů a více než 57 tisíc z nich vykazovalo vysokou diverzitu, přičemž některé kapsidy se lišily až ve 29 aminokyselinách, podstatně více než se liší přírodní varianty virů AAV.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: