Aplikace funkční genomiky v potravinářské mikrobiologii

Přístupy funkční genomiky (ta zahrnuje genomiku, transcriptomiku, proteomiku a metabolomiku)se dnes považují za velmi perspektivní v potravinářské mikrobiologii, především pak pří modelování růstu mikrobiálních kontaminantů. Data získané těmito metodami mohou poskytnout fingerprint (otisk prstů), jenž umožní jak snadnou detekci organismu (genomika), tak jeho fyziologický stav (transkriptomika, proteomika, metabolomika). Poté bude možné navrhnout vhodný antimikrobiální postup v závisloti na získaných datech.

Metody transkriptomiky byly použity při studiu bakterie Bacillus subtilis, která tvoří termostabilní spory. Publikovaná studie odhalila odlišný porfil transkriptomů bakterií kultivovaných v laboratorních podmínkách a kmeny izolovaného přímo z potravin. Tato data pak mohou být použity při návrhu potravinářského procesu, který by měl zabránit přežití odolných bakteriálních spor.

Celý článek naleznete: www.sciencedirect.com