Technologie čtení jediné molekuly DNA odhaluje metylaci u mikrobů

Vědci přečetli 230 různých genomů archaeí a bakterií, aby jejich analýzou prozkoumali roli, jakou hraje metylace DNA u mikrobů. 

Epigenom buňky představuje soubor všech změn komponent DNA, které ovlivňují fungování genomu buňky. Tyto změny jsou přitom výsledkem chemických úprav, obvykle metylace, tedy připojení metylového zbytku k cytosinu a někdy i k adeninu.

Odhalení epigenomické diverzity mikrobů by mohlo přispět k pochopení role mikroorganismů v globálních cyklech jednotlivých chemických prvků a také vystopovat regulační systémy, které u nich fungují na úrovni genomu.

Nejběžnější epigenetická změna, tedy metylace DNA, významně reguluje expresi genů u eukaryot. Už sice víme, že metylace DNA funguje i u archaeí a bakterií, role tohoto procesu v mikrobiální buňce ale zůstává nejasná.

Proto se tým institutu Energy Joint Genome Institute amerického ministerstva energetiky (DOE JGI) rozhodl analyzovat metylaci DNA v genomech 230 bakterií a archaeí. Použili k tomu čtení jediné molekuly DNA, čili technologii SMRT (Single Molecule Real-Time).

Badatelé objevili metylaci DNA v genomech 215 přečtených mikrobů (93 procent). Enzymy metylující DNA (MTázy) jsou podle všeho u mikrobů součástí obrany proti virům a celá řada jich je zřejmě zapojená v regulaci mikrobiálního genomu. Zdá se, že metylace DNA hraje ve fungování buněk archaeí a bakterií mnohem významnější roli, než jsme si mysleli.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: