Superpočítače Comet a Stampede2 hledají léky proti RNA virům

Tým badatelů americké University of New Hampshire (UNH) využil dva americké superpočítače k tomu, aby jim pomohli identifikovat slabá místa RNA virů, která bychom mohli využít v léčbě. Šlo o superpočítače Comet z centra San Diego Supercomputer Center, UC San Diego a Stampede2 v centru Texas Advanced Computing Center.

Výstupy jejich výzkumu by mohly přispět k pochopení toho, jak léčivo působí na strukturu viru a zasahuje do jeho šíření. Na jejich základě by mohla vzniknout nová generaci antivirotik, která budou cílit na nebezpečné RNA viry, jako je například HIV-1, zika, ebola i pandemický koronavirus.

Jak uvádí vedoucí výzkumu Harish Vashisth, jejich tým zahájil výzkum v době, kdy nikoho nenapadlo, že se záhy ocitneme až po krk v pandemii vyvolané RNA virem. Teď ale mohou svůj výzkum hned uplatnit a podpořit s ním vývoj nových a účinnějších léků.

Vashisth a jeho kolegové s pomocí superpočítačů Comet a Stampede2 vytvořili simulace molekulární dynamiky, která se týká interakce mezi fragmentem RNA viru HIV-1 a acetylpromazinem, malou molekulou, o které je známo, že narušuje proces replikace tohoto obávaného viru.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: