Průlom v sekvenování genomů z jediné buňky

Vědci sestavili doposud nejkompletnější genomy z jednotlivých buněk bakterií E. coli a z jednotlivých neuronů lidského mozku.

K průlomu ve čtení DNA jednotlivých buněk došlo díky nové metodě sekvenování buněk (MIcrowell Displacement Amplification System, MIDAS), při které dochází k namnožení genomu v mikronádržkách o objemu 12 nanolitrů.

Podle šéfa výzkumu, kterým byl biotechnolog Kun Zhang z Kalifornské univerzity v San Diegu, už jejich pilotní výzkum naznačil velký potenciál této nové metody. Při sekvenování jednotlivých neuronů jednoho lidského mozku zjistili, že se genomy těchto neuronů navzájem liší. Zřejmě stojíme na prahu éry detailních analýz a porovnávání genomů buněk.

Zhang a spol. také tvrdí, že jejich metoda čtení DNA buněk vede jen k velmi malému počtu chyb při množení genetické informace (amplification bias). Právě to bylo již dlouhou dobu největší technologickou překážkou při sekvenování genomů jednotlivých buněk. Stávalo se totiž, že se při množení genomu pro účely sekvenace různé části genomu kopírovaly nerovnoměrně. To pak pochopitelně komplikovalo mnohé následné analýzy takto přečtených genomů.

Omezení objemu při procesu množení DNA na úroveň nanolitrů podle autorů vedlo k výraznému omezení původních nerovnoměrností a také snížilo možnost kontaminace cizorodou DNA.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: