Datum: 25.7.2014
Jak se zdá, běžně nás obývají viry, o nichž stále nevíme. Tým vedený odborníky ze Státní univerzity v San Diegu zjistil, že ve více než polovině lidstva žije doteď neznámý bakteriofág, pojmenovaný crAssphage.
Podle čerstvé studie v časopisu Nature Communications dotyčný binfikuje běžné střevní bakterie z linie Bacteriodetes, které v současné době podezříváme ze spojení s obezitou, cukrovkou a podobnými poruchami metabolismu.
Šéf výzkumného týmu, bioinformatik Robert Edwards a jeho kolegové se prohrabávali daty z předešlých studií virů obývajících lidská střeva. V sekvencích z výkalů 12 různých jednotlivců si najednou všimli výrazného kusu virové DNA o délce kolem 97 tisíc párů bází, který se vyskytoval ve všech 12 vzorcích. Když Edwards a spol dotyčnou fekální sekvenci porovnali s databází sekvencí všech známých virů, tak zjistili, že tam není.
Vědci ji pak prohnali databází projektu NIH Human Microbiome Project (HMP) a také databází Národní laboratoře Argonne MG-RAST. Ukázalo se, že fág crAssphage je v lidských výkalech úplně běžný.
Člen týmu John Mokili poté použil technologii DNA amplifikace a vystopoval s ní sekvenci viru v původních vzorcích, které byly použity při tvorbě databáze projektu Human Microbiome Project. Vědci teď mají v ruce hmatatelný důkaz, že nejde o šálení počítačových analýz sekvencí a že fekální bakteriofág doopravdy žije ve střevních bakteriích mnohých z nás.
Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.
Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.
Více informací najdete zde:
Gate2Biotech - Biotechnologický portál - Vše o biotechnologiích na jednom místě.
ISSN 1802-2685
Tvorba webových stránek: CREOS CZ
© 2006 - 2024 Jihočeská agentura pro podporu inovačního podnikání o.p.s.
Zajímavé články s biotechnologickým obsahem:
Zaměstnání nabídka - Nabídky zajímavých zaměstnání
Brigády pro studenty - Brigády pro studenty. Nabídky zajímavé práce z celé ČR
Hydromedúzka si regeneruje chapadla za pár dní. Jak to dělá?
Ve Španělsku otevřeli první biobanku s živými vzorky mozkové tkáně