Nově přečtený genom mocným nástrojem pro vývojáře biopaliv

Vědci, kteří se zabývají vývojem technologií produkce biopaliv, teď mají k dispozici čerstvě přečtený genom, který jim pomůže ve výzkumu biotechnologicky významných bakterií.

Tým badatelů Oak Ridge National Laboratory, North Carolina State University a LanzaTech v článku uveřejněným v časopisu Nature Scientific Data popsal metody a výsledky čtení genomu klostridie Clostridium autoethanogenum. Tyto klostridie a jim podobné bakterie mají a budou mít velký význam ve výrobě biopaliv, zemědělství, produkci potravin, ochraně životního prostředí i ve zdravotnictví.

Nový časopis z rodiny časopisů Nature – Nature Scientific Data vznikl proto, aby byly vědecky významné soubory data lépe přístupné odborné veřejnosti. I další vědci teď budou moct pohotově využívat získané zkušenosti z genomu klostridií k úpravě a optimalizaci bakterií v různých biotechnologických aplikacích.

Podle autorů nově přečteného genomu jeho publikace představuje soubor výsledků vysoké kvality, které teď mohou sehrát významnou roli ve vývoji nových technologií čtení genomu i algoritmů, které používá software při zpracování rozsáhlých genomových dat.

Klostridie Clostridium autoethanogenum má mezi odborníky pověst komplexního mikroorganismu s genomem, který obsahuje více než 4,3 milionu párů bází. Přečíst něco takového nebylo úplně snadné a vědci k tomu využili pět různých technologií čtení DNA z celkem tří generací čtení DNA. Autoři také zdůrazňují, že jejich výsledky obsahují šest různých typů dat, ze čtyř různých platforem čtení DNA.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: