Nová laboratoř na čipu analyzuje jednotlivé bakterie

Badatelé centra Biozentrum Univerzity v Bazileji společně s odborníky Max Planck Institutu v Drážďanech vyvinuli novou laboratoř na čipu, kterou doplňuje software pro automatickou analýzu. Jak vědci uvádějí ve článku publikovaném v Nature Communications, toto zařízení je možné využít pro studium regulace genů u jednotlivých bakteriálních buněk v odpovědi na změny v okolním prostředí. 

Zařízení je zhruba velikosti tradiční krabičky zápalek. Přitom je to doopravdy celá mikrokapalinová laboratoř na čipu, která poskytuje spoustu cenných dat. V laboratoři je asi 2 tisíc kanálků o průměru tisíciny milimetru a v každém z nich je jediná bakteriální buňka. Díky tomuto nastavení mohou být buňky velmi detailně studovány.

Laboratoř snímá tisíce mikroskopických snímků za krátké časové úseky. Tím umožňuje po několik dní detailně sledovat růst a chování řady generací jednotlivých bakterií E. coli.

Zařízení generuje velké množství dat, které pak automaticky analyzuje a přesně kvantifikuje pomocí nově vyvinutého softwaru pro analýzu obrazu MoMA.

S tímto novým systémem mohou vědci zkoumat, které přesně geny jsou regulovány v jednotlivých buňkách za měnících se podmínek prostředí. Touto cestou mohou badatelé nahlédnout do procesů regulace genů v bakteriální buňce a rovněž získat přehled o možnostech adaptivních odpovědí bakterií na proměnlivé podmínky prostředí.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: