Nanopórové čtení DNA vylepšeno zpomalením pohybu molekul

Vědci švýcarského EPFL vyvinuli převratnou metodu, která tisíckrát zpřesňuje nanopórové čtení DNA. Na obzoru jsou lepší a lacinější technologie bleskurychlého čtení DNA.

Nanopórové čtení DNA soudobými postupy je velice rychlé. Vlastně až příliš rychlé. DNA prosviští nanopórem tak rychle, že je těžké číst její sekvenci. Aleksandra Radenovic a její kolegové v místním Bioinženýrském institutu proto použili viskózní kapalinu, která pohyb DNA trochu omezí a tím dramaticky vylepší přesnost nanopórového čtení DNA.

Badatelé nejprve vyvinuli velice tenký film ze sulfidu molybdeničitého (MoS2), jehož tloušťka činí 0,7 nanometru, čili přibližně dvojnásobek tloušťky grafenu. Použití grafenu v nanopórovém čtení DNA se ukázalo být poněkud problematické, protože DNA je ve skutečnosti dost lepivá molekula a lepí se na něj. Sulfid molybdeničitý je ale o poznání méně přilnavý, než grafen. Ve filmu ze sulfidu molybdeničitého poté vytvořili nanopóry o průměru necelé 3 nanometry.

Dalším krokem bylo rozpuštění DNA ve viskózní kapalině, která je iontovou kapalinou při pokojové teplotě a obsahuje elektricky nabité ionty. Tým Radenovicové nakonec svůj systém pro nanopórové čtení DNA otestoval přečtením známých sekvencí nukleotidů, které rozpustili ve zmíněné viskózní kapalině a opakovaně je nechali procházet přes nanopóry ze sulfidu molybdeničitého. Vědci tímto způsobem dosáhli přečtení průměrně jednoho ze čtyř prošlých nukleotidů.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: