Mikrobi v sýru si vyměňují spoustu genů

Vědci Kalifornské univerzity v San Diegu zjistili, že si bakterie, které obývají sýry, s nadšením mezi sebou vyměňují geny. Jde přitom o celé tisícovky genů. Rovněž se jim podařilo odhalit hotspoty v bakteriální DNA, jejichž sekvence si bakterie v sýru vyměňují nejraději. 

Vedoucí výzkumu Kevin Bonham a jeho kolegové použili ke svému výzkumu sýry různých typů, z nichž udělali jednoduchý a velmi zajímavý model pro výzkum mikrobiomů, tedy společenstev mikroorganismů. O mikrobiomech víme, že v mnoha případech hrají zásadní roli, ať už jde o lidské zdraví, životní prostředí nebo třeba zemědělství.

Výzkum sýrů nabídl zcela nový způsob, jak studovat výměny genů mezi jednotlivými členy mikrobiomů, k nimž dochází během horizontálního přenosu genů.

Bonham a spol. prozkoumali genomy více než 150 bakterií ze sýra. Ukázalo se, že si tyto bakterie vyměňují přes 4 tisíce různých genů, včetně několika velkých genomických ostrovů, tedy pořádně dlouhých sekvencí DNA, které sdílí mnoho druhů bakterií ze sýru.

Vědci studují horizontální přenos genů už celá desetiletí, ale pokud tento proces chceme poznat v přirozenějších podmínkách, tak je nutné ho zkoumat v mikrobiomech, jako jsou právě společenstva bakterií sýrů, a nikoliv na izolovaných bakteriích.

A o jaké geny vlastně jde? Bonham a jeho kolegové zjistili, že si bakterie v sýru vyměňují hlavně geny, které mají co dělat se získáváním živin, obzvláště pokud jde o železo. Právě konkurence o železo je pro mikroby velmi aktuální v řadě různých prostředí, včetně infekcí patogenních mikrobů v lidském těle.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: