Genomový editor CRISPR si posvítil na temnou hmotu genomu

Nejen ve vesmíru, ale i v genomech je temná hmota. O naprosté většině DNA nevíme, co vlastně dělá a jestli vůbec něco dělá. Ve výzkumu temné hmoty genomů se teď stal velice užitečným pomocníkem oblíbený genomový editor CRISPR. 

V dnešní době máme rámcovou představu, jak fungují cca 2 procenta lidského genomu – ty, které kódují geny. Podíváme se do genomu a vidíme, kde takový gen začíná, kde zase končí, a z čeho se skládá. Jenomže geny jsou v genomu jako ostrůvky, které jsou ztracené v moři neznáma.

O zbývajících 98 procentech genomu jsou naše znalosti jenom kusé. Významnou část temné hmoty zřejmě představuje nesmyslný šum. Nevíme ale, jak velká ta část je. Tajemství nekódujících oblastí genomu odhalujeme jen velmi zvolna a s velkou námahou. A celkový obrázek poměrů v temné hmotě genomů je zatím mimo náš dosah.

Podle ředitele Broad Institute Erica Landera se celých 90 procent genetický faktorů, které ovlivňují lidská onemocnění, vyskytuje právě v nekódujících oblastech genomů. A zatím vůbec nejsme s to říct, které regulační sekvence z temné hmoty genomů ovlivňují které geny.

Prestižní časopis Science teď vydal dvojici článků, v nichž dva výzkumné týmy různých pracovišť Broad Institute nezávisle na sobě popsali využití genomového editoru CRISPR k průzkumu temné hmoty genomů. Udělali z něj baterku a na temnou hmotu si důmyslným způsobem posvítili.

Badatelé obou dvou týmů použili geniální CRISPR k systematickému sondování tisíců kusů sekvencí nekódující DNA současně. Oba dva týmy odhalili několik zajímavých regulačních sekvencí, včetně takových, které se v genomu nalézají ve vzdálenosti milionů bází daleko od jimi regulovaných genů.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: