Hlavní stranaZpravodajstvíEditor INTEGRATE využívá CRISPR a triky skákajících...

Editor INTEGRATE využívá CRISPR a triky skákajících sekvencí

Datum: 23.12.2019 

Genový editor CRISPR je bezesporu zázrakem moderní vědy. Jeho mechanismus má ale, vcelku pochopitelně, do ideálního nástroje daleko. Je to, konec konců, původně imunitní strojek bakterií. Vědci americké Columbia University vyvinuli vylepšenou verzi CRISPRu, která nese označení INTEGRATE. Funguje podobně jako původní editor, ale jemněji. Více chirurgicky.

Kredit: Sternberg and Fernández Labs/Columbia University Irving Medical Center.INTEGRATE využívá „skákající sekvence“, čili transpozony, které dovedou propasírovat dlouhé sekvence DNA do genomu, aniž by řetězce DNA rozstřihly. Sam Sternberg a jeho kolegové rovněž tento proces poprvé zobrazili a sledovali prakticky v přímém přenosu.

Vlepování nových sekvencí DNA, aniž by došlo k přerušení DNA stávajícího genomu, představuje nový typ využití editorů typu CRISPR a celou novou skupinu těchto editorů. Jedním z nich je i systém INTEGRATE, čili Insertion of Transposable Elements by Guide RNA-Assisted Targeting.

Sternberg a spol. vyvinuli INTEGRATE poté, co objevili zajímavé transpozony Tn7-like v obávané bakterii Vibrio cholerae. Tyto transpozomy se pohybují po genomu vibria tak, že využijí jeho enzymy k tomu, aby se prostě vlepily na nové místo v genomu.

Badatelé přeprogramovali systém CRISPR a nahradili původní enzym Cas zmíněnými bakteriálními transpozony. Vznikl tím systém INTEGRATE, který umožňuje vlepovat do genomu sekvence DNA o délce až 10 tisíc bází.

Když pak pomocí kryo-elektronové mikroskopie detailně pozorovali INTEGRATE v akci, tak si potvrdili, že INTEGRATE funguje podle jejich představ. S novým genetickým editorem teď bude možné editovat genom ještě šetrněji, efektivněji a hlavně přesněji.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.


google facebook Digg delicious reddit furl mrwong myspace twitter stumble upon topclanky Jagg bookmarky Linkuj si ! pridej Vybralisme

Více informací najdete zde:


49

Komentáře / diskuse


Váš komentář:







 

OPPI, MPO, EU

CEBIO a I. etapa JVTP

  • CEBIO
  • BC AV CR
  • Budvar
  • CAVD
  • CZBA
  • Eco Tend
  • Envisan Gem
  • Gentrend
  • JAIP
  • Jihočeská univerzita
  • Madeta
  • Forestina
  • ALIDEA

LinkedIn