Diagnózu původců otravy krve zrychlí čtení jejich DNA

Když u někoho propukne otrava krve, čili sepse, tak jde o život. V takovém případě záleží doslova na každé minutě. Pokrok v technologiích čtení DNA teď umožňuje spolehlivě diagnostikovat původce sepse do 24 hodin. 

Badatelé německého Fraunhoferova institutu názorně předvedli, že to funguje. Použili přitom vysoce účinné čtení DNA (high-throughput sequencing) a algoritmy pro analýzu takto získaných dat.

Jen v Německu se otrava krve každoročně objeví asi u 150 tisíc pacientů. Navzdory veškeré moderní medicíně jich 30 až 50 procent na následky otravy krve zemře.

Takto vysoká úmrtnost je způsobena i tím, že přesná diagnóza patogenu, odpovědného za konkrétní případ sepse, často přichází příliš pozdě. Lékaři nemají dost času na to, aby pacientovi nasadili specifická antibiotika. Původci sepse bývají diagnostikováni pomocí krevních kultur, v nichž musí patogen nejprve narůst do určitého množství, a to je příliš zdlouhavé. Výsledky bývají k dispozici tak za 2 až 5 dní.

Teď je ale díky mohutnému rozvoji technologií čtení DNA a následné analýzy ohromného množství dat možné přečíst kompletní DNA patogenu za pár hodin. Se sekvencí v ruce je pak už obvykle hračkou určit správné antibiotikum.

Vědci Fraunhoferova institutu vyvinuli platformu pro diagnostiku patogenů sepse. Tato platforma umožňuje identifikovat bakterie, houby nebo viry analýzou sekvence DNA, aniž by bylo nutné patogeny kultivovat v laboratoři. S novou platformou a ve spolupráci s univerzitní nemocnicí v Heidelbergu uskutečnili klinickou studii, která prokázala, že tímto způsobem lze úspěšně diagnostikovat patogeny sepse z DNA v krvi pacientů.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: