Botanici poprvé určili rostliny přečtením DNA přímo v terénu

Během posledních 40 let DNA s velkou parádou dobyla svět vědy. Dnes se kolem DNA točí ve vědě snad vše. Až donedávna ale výzkum DNA zůstával mezi zdmi laboratoří. Pokud někdo chtěl určit druh organismu pomocí sekvence DNA, od odebrání vzorku do výsledky to obvykle zabralo celé měsíce. 

Určování neznámých organismů je přitom těsně spojeno s výzkumem přímo na místě, v terénu. Čím dříve je takový organismus správě pojmenován, tím lépe. Proto by bylo skvělé mít dostupné a přenosné technologie, s nimiž bude možné určit organismy přímo v terénu, pokud možno okamžitě. To velmi uvítají terénní biologové, forenzní vědci i ochránci přirody.

A takové technologie už existují. Tým vědců britských Kew Gardens použil velmi populární přenosnou čtečku MinION od Oxford Nanopore Technologies k určení rostlin v Národním parku Snowdonia. Bylo to poprvé, kdy někdo použil čtení genomu rostlin v terénu.

Čtečky MinION jsou k mání na trhu od roku 2015. Už se osvědčily v Antarktidě, zapadlých oblastech postižených epidemií i na Mezinárodní vesmírné stanici.

Vědcům z Kew se podařilo s MinIONem v térénu identifikovat dva blízce příbuzné huseníčky Arabidopsis thaliana a Arabidopsis lyrata ssp. petraea. Přečetli náhodně vybrané části genomu huseníčků, čím se vyhnuli stávajícímu zdlouhavému postupu čtení specifických úseků genomu.

Po přečtení DNA badatelé porovnali získaná data s volně dostupnou databází rostlinných genomů a určili, o jaké rostliny jde. Poté ještě potvrdili své výsledky v laboratoři Jodrell Laboratory v Kew Gardens, kde přečetli DNA studovaných rostlin jiným způsobem.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: