Hlavní stranaZpravodajstvíArchaea poskytla genetikům maličký genetický editor

Archaea poskytla genetikům maličký genetický editor

Datum: 22.10.2018 

Organismy skupiny archaeí mají ve svých buňkách řadu zvláštních a výjimečných molekulárních mechanismů a nástrojů. Teď v nich vědci objevili nejmenší známou verzi úspěšného genetického editoru CRISPR. A nebojí se ji použít.

Kredit: NHGRI.„Trpasličí“ protein tohoto editoru dostal označení Cas14. Jeho velikost je přitom oproti nejčastěji používané variantě, tedy proteinu Cas9, jen asi třetinová. Editor CRISPR-Cas9 jsme objevili u bakterií, novou verzi CRISPR-Cas14 badatelé našli u jedné skupiny archaeí.

Různé varianty systému CRISPR-Cas vlastně představují důmyslný obranný systém mikroorganismů proti virům. Není sice stoprocentně úspěšný, ale svou práci zastane dobře. Proteiny Cas velmi selektivně vyhledávají specifické DNA či RNA sekvence. Mikroorganismy mají díky systému CRISPR paměťovou databázi sekvencí virů, s nimiž se již setkaly. V případě nové invaze nějakého z těchto virů mohou mikrobi pomocí proteinů Cas virové sekvence detekovat a zlikvidovat.

Stejně jako jiné proteiny rodiny Cas má i Cas14 slušný potenciál pro využití v biotechnologiích. Vzhledem k malé velikosti se s tímto proteinem bude dobře pracovat. Mohl být užitečný zejména pro editování sekvencí v malých buňkách či dokonce virech. Nejvíce by se ale prý mohl uplatnit v CRISPR systémech pro rychlou diagnostiku, které v současné době vznikají. Takové systémy bude možné používat například k detekci infekčních onemocnění, genetických mutací nebo rakoviny.

První autor vědecké studie Lucas Harrington z Kalifornské univerzity v Berkeley říká, že každý z různých proteinů Cas exceluje v určitém typu detekce sekvencí. Například protein Cas12 je výborný v rozeznávání sekvencí na dvouřetězcové DNA, Cas13 je skvělý v práci s jednořetězcovou RNA a „trpasličí“ Cas14 je výtečný v detekci sekvencí na jednořetězcové DNA.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.


google facebook Digg delicious reddit furl mrwong myspace twitter stumble upon topclanky Jagg bookmarky Linkuj si ! pridej Vybralisme

Více informací najdete zde:


49

Komentáře / diskuse


Váš komentář:







 

OPPI, MPO, EU
Czech Bio

CEBIO a I. etapa JVTP

  • CEBIO
  • BC AV CR
  • Budvar
  • CAVD
  • CZBA
  • Eco Tend
  • Envisan Gem
  • Gentrend
  • JAIP
  • Jihočeská univerzita
  • Madeta
  • Forestina
  • ALIDEA

LinkedIn